Encyclopedia of Life. iTOL: Interactive Tree Of Life. Angiosperm Phylogeny Group. Un article de Wikipédia, l'encyclopédie libre.
Pour les articles homonymes, voir APG. L'Angiosperm Phylogeny Group (APG) est un groupe de botanistes qui travaillent sur la phylogénétique végétale, en utilisant les techniques moléculaires et l'analyse cladistique. Ce groupe a publié trois classifications botaniques : La classification APG (1998), par les auteurs : Arne A. Anderberg, Anders Backlund, Birgitta Bremer, Kåre Bremer, Barbara G.Biggs, Mark W. N.B. De nombreuses institutions sont représentées parmi les principaux auteurs de APG, parmi lesquelles : Portail de la botanique.
Google Earth phylogenies. Now, for something completely different.
I've been playing with Google Earth as a phylogeny viewer, inspired by Bill Piel's efforts, the cool avian flu visualisation Janies et al. published in Systematic Biology (doi:10.1080/10635150701266848), and David Kidd's work. As an example, I've taken a phylogeny for Banza katydids from Shapiro et al. (doi:10.1016/j.ympev.2006.04.006), and created a KML file. Unlike Bill's trees, I've drawn the tree as a phylogram, because I think biogeography becomes much easier to interpret when we have a time scale (or at least a proxy, such as sequence divergence). I've converted COI branch lengths to altitude, and elevated the tree off the ground to accomodate the fact that the tips don't all line up (this isn't an ultrametric tree). Wouldn't it be fun to have a collection of molecular trees for Hawaiian taxa for the same gene, plotted on the same Google Earth map?
GenBank.
Phylogenetics. Important Phylogenetic Software ATV ATV (A Tree Viewer) is a Java tool for the visualization of annotated phylogenetic trees. ATV reads standard "New Hampshire" format tree files (as produced by all major phylogenetic analysis software). ATV also implements an extended superset of New Hampshire format called NHX format, which allows to extensively annotate a tree. ATV can be used both as application and as Applet. It requires Java version 1.5 or higher. BEAST BEAST is a cross-platform program for Bayesian MCMC analysis of molecular sequences. GeneiousGeneious provides sophisticated genome & proteome research software, sequence alignment, protein or molecular visualization, publication literature search and storage software and more, with revolutionary usability.
MacCladeMacClade is a computer program for phylogenetic analysis written by David Maddison and Wayne Maddison. MrBayesMrBayes is a program for the Bayesian estimation of phylogeny. More Software links Online Software Tools. Sagascience, collection de dossiers thématiques en ligne. Jean Rouch, l'ethnologue-cinéaste De sa rencontre avec l’Afrique, en 1941, à son dernier voyage au Niger, en 2004, en passant par son entrée au CNRS à la fin des années 1940, le parcours de Jean Rouch continue d’intriguer, de passionner, d’influencer, de susciter des vocations.
Il filmait les rites de possession sans pouvoir les comprendre tout à fait, il brisait des interdits et des tabous, tant techniques que sociaux, il cherchait à faire comprendre ce qu’il voyait. Voir le dossier Exoplanètes, à la recherche de nouveaux mondes? En octobre 1995, une équipe d’astrophysiciens, dirigée par Michel Mayor et Didier Queloz à l’observatoire de Haute-Provence, détecte pour la première fois de façon formelle une exoplanète : 51 Pégasi b, un Jupiter chaud.
Voir le dossier Exoplanets, the search for new worlds? Eric Karsenti, l'aventurier du vivant Éric Karsenti est le lauréat 2015 de la médaille d’or du CNRS. Voir le dossier. Angiosperm Phylogeny Website.