
Blog Revolution - statistics by Terry M. Therneau Ph.D.Faculty, Mayo Clinic About a year ago there was a query about how to do "type 3" tests for a Cox model on the R help list, which someone wanted because SAS does it. The SAS addition looked suspicious to me, but as the author of the survival package I thought I should understand the issue more deeply. First off, what exactly is this 'type 3' computation of which SAS so deeply enamored? To compute this, one can start by fitting a sufficiently rich model, get predicted values for our age distribution, and then average them. A primary statistical issue with type 3 is the choice of reference. Average population prediction also highlights a serious deficiency in R. R needs a general and well thought out post-fit contrasts function. Also, I need to mention a couple more things: The standard methods for computing type 3 that I see in the help lists are flawed, giving seriously incorrect answers unless sum-to-zero constraints were used for the fit (contr.sum).
[FRENCH] Data Mining avec R dans un monde libre R est un langage et un environnement pour les calculs statistiques et leurs représentations graphiques. R est similaire au système S qui a été récompensé par le Software System Award de l'ACM (Association for Computing Machinery) et qui est la plate-forme du logiciel commercial S-Plus. Rappelons quelques technologies reconnues par la récompense ACM à savoir UNIX, TeX, PostScript, TCP/IP, World-Wide Web, Tcl/Tk, et Apache. Le but de l'article précédemment paru dans le FI 2/01 [1] était de fournir un point de départ pour les novices intéressés par R [2]. Le présent article se propose d'illustrer les interfaces existantes entre R et des bases de données relationnelles, ces interfaces étant un premier pas des logiciels statistiques modernes, comme R, vers la reconquête par les statisticiens du domaine du Knowledge Discovery in Databases (KDD). Qu'est-ce que le data mining? «We are drowning in information, but starving for knowledge.» Les bases de données et SQL On aura l'affichage: