Amazing interactive 3D scatter plots - R software and data visualization - Documentation - STHDA I recently posted an article describing how to make easily a 3D scatter plot in R using the package scatterplot3d. This R tutorial describes how to perform an interactive 3d graphics using R software and the function scatter3d from the package car. The function scatter3d() uses the rgl package to draw and animate 3D scatter plots. The packages rgl and car are required for this tutorial: install.packages(c("rgl", "car")) Note that, on Linux operating system, the rgl package can be installed as follow: sudo apt-get install r-cran-rgl Load the packages: library("car") We’ll use the iris data set in the following examples : data(iris)head(iris) Sepal.Length Sepal.Width Petal.Length Petal.Width Species 1 5.1 3.5 1.4 0.2 setosa 2 4.9 3.0 1.4 0.2 setosa 3 4.7 3.2 1.3 0.2 setosa 4 4.6 3.1 1.5 0.2 setosa 5 5.0 3.6 1.4 0.2 setosa 6 5.4 3.9 1.7 0.4 setosa sep.l <- iris$Sepal.Lengthsep.w <- iris$Sepal.Widthpet.l <- iris$Petal.Length library(car) scatter3d(x = sep.l, y = pet.l, z = sep.w) Default plot
Étang Un article de Wikipédia, l'encyclopédie libre. Ne doit pas être confondu avec lac ni mare. Étang dans le Nord de l'Allemagne ; dans ce cas, l'évaporation est diminuée par une moindre surface libre, mais en partie au moins compensée par l'évapotranspiration qui injecte dans l'air des quantités significatifs de vapeur d'eau (qui contribuera à la rosée, aux brumes et aux pluies), via le cycle de l'eau L'infiltration de Gleißenbach, située à environ 500 mètres au nord de l'étang de Deiniger. l'eau correspondant au trop plein de l'étang de Deininger s'écoule d'abord dans la rivière Gleißental, puis après quelques centaines de mètres de s'enfonce dans le sol. Ce type de situation est propice à la pollution directe et brutale de nappes souterraines Définition[modifier | modifier le code] Il existe de nombreuses définitions de l'étang. Étymologie[modifier | modifier le code] En français, le verbe stagner est un emprunt récent (XVIIIe siècle) au latin classique. Historique[modifier | modifier le code]
Astuce Archives Je ne sais pas pour vous, mais moi, à chaque fois que j'assiste à une réunion de labo, il y a quasi systématiquement un graphique d'ACP pour montrer les données. Et à chaque fois, il s'agit d'un graphique de base, généré avec R, avec la fonction plot(), des couleurs qui piquent les yeux et des axes et légendes illisibles. La critique est facile me direz-vous, j'avoue avoir moi aussi présenté ce genre de graphique assez souvent... La diversité des questions que se posent nos amis biologistes entraîne une diversité des données : génomiques, images, etc. De plus, ces données sont générées à des vitesses folles. TL;DR La reproductibilité, c’est la vie (dans le monde scientifique) ! Certains bio-informaticiens ne jurent que par R (j'en fais partie). Bonjour à tous, et bienvenue dans le premier épisode d'une (longue ?) Lorsque vous êtes sur le point de publier, il va bien falloir expliquer aux futurs lecteurs comment vous avez obtenu les résultats...
Dictionnaire juridique clinicR: groupe d'utilisateurs de R à la FMV 21 janvier 2016 Où?: local 115, pavillon Dessaulles clinicR est le RUG (R User Group) de la Faculté de médecine vétérinaire de l'Université de Montréal. Agenda Rencontre #8: Analyse quantitative des biais avec episensr Évaluation des biais avec le package episensr. Rencontre #7: Graphiques dans R Comment réaliser des graphiques dans R, à partir des graphiques de base et du package ggplot2. Rencontre #6: Gestion de données dans R (3) et Dates et temps dans R Deux sessions: (1) Appliquer des fonctions sur des groupes de variables, agrégation de données, combinaisons de jeux de données, passer du format "long" au format "large"; (2) manipulation de dates et temps avec R. Rencontre #5: Gestion de données dans R (2) Opérations sur les variables et observations. Rencontre #6: Gestion de données dans R (3) Agrégation et combinaison de données. Rencontre #7: Gestion de données dans R (4) Travailler avec des dates dans R. Rencontre #4: Gestion de données dans R (1) Windows Mac OS X Linux Firefox SQLite Plugin
Dictionnaire de l'informatique et d'internet - DicoFR Code School - Try R Cours Programmation R R est à la fois un logiciel de statistique et un langage de programmation. R est un logiciel de traitement statistique des données. Il fonctionne sous la forme d'un interpréteur de commandes. Il dispose d'une bibliothèque très large de fonctions statistiques, d'autant plus large qu'il est possible d'en intégrer de nouvelles par le système des "packages", des modules externes compilés (sous forme de DLL sous Windows) que l'on peut télécharger gratuitement sur internet. R propose également une palette étendue de fonctionnalités graphiques. R est un langage de programmation (de script) interprété dérivé de S (disponible dans le logiciel S-PLUS). Au fil des années, R sera de plus en plus incontournable dans le traitement exploratoire et statistique des données. Cet enseignement est avant tout un cours de programmation. Ce cours est dispensé en M2 Statistique et Informatique (SISE). Ricco Rakotomalala – Université Lyon 2
Didacticiel Vous avez surement déjà entendu un barbu vous dire "Tu vas voir LaTeX c'est génial, tu peux même dessiner des molécules avec !". Et du coup vous vous êtes dit que c'est vrai que ça a l'air bien vu qu'on peut même dessiner des molécules avec ! Et effectivement, on peut ! La molécule suivante a été faite avec LaTeX (le premier qui trouve ce que c'est, gagne… le droit de nous écrire un article sur le sujet de son choix)... Bonjour à tous et soyez les bienvenus dans ce 3ème cours de R pour débutant pressé. Derrière ce titre énigmatique, qui n'aura pas été sans vous rappeler la fameuse phrase du Petit Prince d'Antoine de Saint Exupéry, se cache un module pour Python qui dira sûrement quelque chose à nos lecteurs assidus spécialisés dans les graphes : pygraphviz ! Je sais pas pour vous mais dans mon labo, le premier réflexe de mes collègues lorsqu'il faut faire une figure ou un poster c'est soit de dégainer la suite Ad*be, soit d'ouvrir P*werPoint. Connaissances requises