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Gephi

Gephi
Fonctionnalités générales Gephi est un logiciel pour visualiser, analyser et explorer en temps réel les graphes (aussi appelés réseaux ou données relationnelles) de tout type. Sorte de Photoshop pour les réseaux, l'utilisateur interagit avec la représentation graphique, manipule les structures, formes et couleurs pour en révéler les propriétés cachées via des saillances visuelles. L'objectif est de faciliter l'analyse de données dans la génération d'hypothèses, la découverte intuitive de patterns, l'isolement de singularités ou la détection d'erreurs liées à la captation des données. C'est un outil complémentaire à l'analyse statistique, qui se positionne dans le mouvement de l'Analyse Exploratoire des Données. La liste des fonctionnalités est disponible sur cette page. Autres fonctionnalités Gephi se dinstingue par : Interopérabilité Entrée fichiers de graphes : CSV, GDF, GEXF, GML, GraphML, Graphviz DOT, Pajek NET, Tulip TLP, Ucinet DL, XGMML.

Data Visualization Software | Tulip Cytoscape Fonctionnalités générales Cytoscape est un logiciel utilisé par les biologistes qui permet la visualisation et l'analyse des réseaux d’interaction et des données associées (interaction protéines-protéines, gènes coexprimés, annotations de Gene Ontology...). Les représentations graphiques d'un même réseau sont multiples (formes des réseaux, couleurs, taille, informations, ...). Le logiciel permet de naviguer simplement dans des grands réseaux et permet de faire des filtres. Cytoscape peut se connecter directement aux banques de données publiques pour obtenir les informations qu'elles contiennent (Entrez Gene, BioMart, IntAct...). Autres fonctionnalités La version téléchargée contient des outils de visualisation et d'intégration des données, complétée par des plugins développés par les développeurs du logiciel Cytoscape et les utilisateurs eux-mêmes. Interopérabilité Permet de sauvegarder et d'importer les réseaux à différents formats : Contexte d'utilisation dans mon laboratoire/service

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